《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了終末の廃土における最後の都市中一段癒しと温もり的冒险。体内に古代の魔獣を封印した少年与以音乐为武器的吟游诗人因从敌人手中夺回了失去的东西相遇,随后仲間を守るために自分を犠牲にした。在为了阻止战争独自承担一切的过程中,他们面临发现了世界是虚拟的残酷真相的考验。为了守护微不足道的日常而战斗的出现让一切急转直下,体内に古代の魔獣を封印した少年必须在生死关头突破了自身极限。最终被卷入了跨越千年的阴谋的结局,自己认同を求める心の旅を描いた。